تألق
محمد بركات مع النادي الإسماعيلي مواسم 1999 و 2000 و2001 و2002، وقاد الإسماعيلي لبطولتي كأس مصر والدوري المصري.
أنتقل محمد بركات بمبلغ قياسي موسم 2002-2003 للأهلي السعودي، استطاع
الوصول إلى نهائي الدوري السعودي، لقد قدم موسم رائع لكن لم يحالفه الفوز
بأنجاز محلي بالرغم من وصول فريقه أهلي جدة إلى جميع النهائيات المحلية في
ذلك العام، كماانه فاز مع أهلي جدة ببطولة الاندية العربية الموحدة الأولى
لكرة القدم يناير 2002 التي استضافها اتحاد جدة من أمام الإفريقي التونسي
وقد سجّل هدف المباراة الوحيد.
ثم أنتقل بالموسم التالي 2003-2004 لنادي العربي القطري.. ولعب مع باتيستوتا لكن الإصابة منعته من استكمال المشوار
فرحل محمد بركات عن قطر، أنتقل بركات بموسم 2004-2005 للنادي الأهلي
تألق وأبدع معه وقاده لأحراز بطولة دوري أبطال أفريقيا وتوج بركات هدافاً
لهذه البطولة برصيد 6 أهداف وتحصل علي لقب أفضل لاعب بأفريقيا " أفضل لاعب
أفريقي محلي "،
الأصابة عادت من جديد لتأرق محمد بركات بموسم 2005-2006 فلم يلعب
مباريات كثيرة إلا مباراة الصفاقسي بنهائي دوري أبطال أفريقيا وقد شارك
فيها لبضع دقائق.